基于ITS-nrDNA的疫霉属系统进化分析
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作者单位:

广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西农业科学院经济作物研究所,广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西壮族自治区亚热带作物研究所

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中图分类号:

S41

基金项目:

现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-19-S15);广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(桂热研201206)


Phylogeny of Phytophthora species based on ITS-nrDNA Sequences Analysis
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    摘要:

    基于对GenBank下载的121株疫霉菌Phytophthora的核糖体DNA的ITS序列分析,以Pythium sylvaticum为外围群,按最大简约法(Maximum parsimony)构建其系统发育树,以对疫霉菌的系统发育关系进行研究。结果表明,疫霉属总体上可分为5个类群;P. undulata和P. batemanensis与Pythium sylvaticum的亲缘关系近,而与疫霉属的亲缘关系远;ITS 序列分析结果不支持P.cryptogea和P.drechsleri为同物异名的观点。

    Abstract:

    Based on maximum parsimony phylogeny tree of ITS-nrDNA sequences of 121 isolates downloaded from GenBank, A phylogenetic tree was constructed by the MEGA4.0 package by Maximum parsimony method. Their phylogenetic relationships were studied. The present results showed that Phytophthora species were clustered into five groups. The analysis of ITS-nrDNA sequences didn’t support the idea that P.cryptogea and P.drechsleri are synonymous. The MP (Maximum parsimony) tree also showed that P. undulata and P. batemanensis was more homogenous with Fythium. The other Phytophthora species were also discussed in this paper.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

金 刚,陈 涛,唐向民,等. 基于ITS-nrDNA的疫霉属系统进化分析[J]. 科学技术与工程, 2014, 14(1): .
JIN Gang, CHEN Tao, TANG Xiang-min, et al. Phylogeny of Phytophthora species based on ITS-nrDNA Sequences Analysis[J]. Science Technology and Engineering,2014,14(1).

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  • 收稿日期:2013-08-14
  • 最后修改日期:2013-08-14
  • 录用日期:2013-09-09
  • 在线发布日期: 2014-01-21
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